公司稅務異常問題的處理是一個涉及多個環節和部門的過程。以下是根據稅務部門和相關法規整理的詳細處理指南：
一、識別稅務異常
首先，公司需要明確稅務異常的具體表現。常見的稅務異常包括：
逾期未申報或未繳納稅款
稅務報表填寫錯誤
涉嫌偷稅漏稅
稅務登記信息不準確等
一旦發現這些問題，公司應立即采取行動，防止情況進一步惡化。
二、內部自查與整改
在明確稅務異常后，公司應立即開展內部自查。通過梳理公司財務數據、稅務申報記錄等資料，找出導致稅務異常的具體原因。針對發現的問題，公司應制定整改計劃，并在規定的時間內完成整改。整改過程中，公司應嚴格遵守相關法律法規，確保整改工作的合法性和有效性。
三、與稅務機關溝通
在自查與整改的同時，公司應主動與稅務機關取得聯系，了解稅務機關對公司稅務異常的具體要求和整改建議。公司應積極配合稅務機關的工作，如實提供相關資料和解釋說明，爭取稅務機關的理解和支持。通過與稅務機關的溝通，公司可以更加清晰地了解稅務異常的原因和后果，為后續的整改工作提供有力支持。
四、提供稅務異常情況說明
企業需要向稅務部門提供稅務異常情況說明，解釋導致稅務異常的具體原因，并提供解除稅務非正常狀態的正當理由。這是稅務異常處理的前提和基礎，有助于稅務機關了解公司的實際情況并作出相應的處理決定。
五、稅務部門審核及受理
辦稅服務廳接收申請材料后，會核對納稅人報送的材料是否齊全、是否符合法定形式。如果材料齊全且符合法定形式，稅務部門將受理申請；如果材料不齊全或不符合法定形式，稅務部門將駁回申請，并告知納稅人應補正的資料或不受理的原因。
六、相關部門調查核實
稅務部門受理申請后，相關部門將對企業的稅務異常情況進行調查核實，以確定稅務異常的具體原因和性質。他們會通過查閱公司的賬務資料、詢問公司相關人員等方式，了解并確認稅務異常的具體情況和原因。這一步是稅務異常處理的關鍵環節，有助于確保處理的準確性和公正性。
七、補繳稅款、滯納金及罰款
對于逾期未申報或未繳納的稅款，公司應及時補繳并支付相應的滯納金。在補繳稅款時，公司應確保稅款計算準確無誤，避免出現新的稅務異常。同時，如果稅務異常問題涉及罰款，公司也應按照稅務機關的要求及時繳納罰款。
八、解除非正常稅務狀態
在公司完成補充申報、補繳稅款、滯納金及罰款等操作后，稅務部門會解除公司的非正常稅務狀態。這意味著公司的稅務異常問題已經得到解決，可以恢復正常的稅務活動。