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股東變更稅務的辦理流程通常包括以下幾個步驟：
一、準備相關資料
在辦理股東變更稅務登記前，應準備以下相關資料：
變更后的營業執照副本及復印件：這是證明公司合法經營和股東變更的重要證件。
變更后的組織機構代碼證及復印件：如公司已有組織機構代碼證，需同步更新并提供復印件。
工商局變更后的核準通知書：證明股東變更已經得到工商局的正式批準。
公司章程修正案或新章程：明確載明新任股東或股權變更的相關信息。
股東會議決議：全體股東同意變更的決議，并加蓋公司公章。
新股東或法人身份證復印件：用于驗證新股東或法人的身份。
二、稅務申報與繳納股權轉讓稅務申報：如涉及股權轉讓，轉讓方需作為納稅義務人，受讓方作為扣繳義務人，共同向主管稅務機關辦理納稅（扣繳）申報。
繳納稅費：根據股權轉讓所得，計算并繳納個人所得稅、印花稅等相關稅費。
三、辦理稅務變更登記前往稅務局：帶齊上述資料，前往公司注冊地稅務局辦理稅務變更登記。
填寫稅務登記變更表：領取并如實填寫稅務登記變更表，提交相關證件和資料。
稅務機關審核：稅務機關對提交的證件和資料進行審核，符合規定的，予以受理；不符合規定的，通知其補正。
領取新稅務登記證：稅務機關審核通過后，頒發新的稅務登記證，上面會載明新的股東信息。