一、原核細胞在整體上，原核細胞可通過改變核糖體結合位點（RBS）序列或者在RBS鄰域制造二級結構來阻止小亞基和mRNA的結合進而阻止翻譯的起始。一方面由于RBS序列固定，改變其序列將會造成所有mRNA停止翻譯。另一方面由于改變序列并非快速準確的調控方法，針對單個轉錄本，原核細胞傾向于采取以下幾種方式進行調控：
（1）蛋白依賴的——通過蛋白質特異性結合到RBS和起始密碼子AUG之間的序列以通過物理方式阻止小亞基和mRNA結合，但該特異性序列不能包括RBS（否則將可能會導致所有轉錄本停止翻譯）。
（2）mRNA依賴的——通過ORF和下游序列的雜交來阻止該ORF的起始。但如果該ORF上游有其他開放起始位點，則該ORF可以被上游翻譯啟動（核糖體翻譯到下游時，將其解旋），這樣的好處是當且僅當個ORF翻譯時，第二個ORF才可以翻譯。
