醫院設有皮膚科、脾胃病科、針灸中心、心血管科、瘡瘍外科、腫瘤科、急診科、護理學、皮膚科、脾胃病科、針灸中心、心血管科、瘡瘍外科、腫瘤科、急診科、護理學、腎病科、心身醫學科、藥學部、婦科、骨科、兒科、肛腸科、康復科、呼吸科、風濕病科等科室。其中，衛生部國家臨床重點專科8個（皮膚科、脾胃病科、針灸中心、心血管科、瘡瘍外科、腫瘤科、急診科、護理學），國家中醫藥管理局重點專科13個（皮膚科、脾胃病科、針灸中心、心血管科、瘡瘍外科、腫瘤科、急診科、護理學、腎病科、心身醫學科、藥學部、婦科、骨科），北京市中醫管理局重點專科5個（兒科、肛腸科、康復科、呼吸科、風濕病科），北京市中醫特色診療中心7個（中醫皮膚科、中醫心血管、消化中心、針灸、中醫兒科、中醫婦科及中醫治未病中心）。另外，還設有北京市中醫研究所、北京市中藥研究所、北京市國際針灸培訓中心、北京市趙炳南皮膚病研究中心等。
北京中醫醫院醫院設立有6個醫技科室：放射科、核醫學科、病理科、醫學檢驗科（包含輸血科）、超聲診斷科、營養科。配備大型醫療設備近50種：如3.0T磁共振儀、256層極速CT、數字平板血管造影系統、SPECT/CT、超聲內鏡、雙板數字DR、心臟三維標測系統、全自動智能采血系統、全數字平板乳腺攝影系統、聚焦超聲腫瘤消融機、數字胃腸造影系統、彩色超聲診斷系統、術中CT、全自動生化分析儀等現代化醫療設備。中藥房常備中藥飲片近660種，諸多院內制劑來源于名老中醫及專家的驗方、秘方和科研成果，現有批準文號的院內制劑192種，其中中藥制劑164種，丸、散、膏、顆粒、膠囊、洗劑、酊劑、油劑等近20種劑型，70余種為臨床常用制劑。病房煎藥室始終保留一人一方，直火砂鍋煎藥的傳統煎藥模式。
醫院承擔著本科生、碩士生、博士生的教學任務, 截止到2018年7月，擁有中醫專科教研室20個，擁有學科碩士培養點9個。擁有博士生導師11人、碩士生導師47人。教授、副教授共55人；共獲科研成果獎240項，其中省部級以上科研獎95項。
個人簡介
孟廣松，副主任醫師，首都醫科大學畢業，中華醫學會會員，中華中醫藥學會會員，中國醫師協會會員。2002年開始在北京中醫院臨床工作至今，擅長中醫養生調理，亞健康調理，體質調理。運用中醫傳統辯證體系，如：三焦辨證、六經辨證、八綱辨證、衛氣營血辨證等思辨體系，診治臨床慢性、疑難疾病。
社會任職
中國中醫藥信息研究會全科醫學分會理事
北京中醫藥學會肺系病專業委員會委員
李伯華 副主任醫師：專業擅長
蕁麻疹、濕疹（特應性皮炎）、白癜風、帶狀皰疹及后遺神、掌跖病、、瘙癢癥、口腔潰瘍
個人簡介
李伯華，碩士，副主任醫師，講師，中醫皮膚科專業，畢業于上海中醫藥大學，師承上海顧氏、夏氏皮外科傳人李斌、張明教授，工作后致力于趙炳南中醫皮科流派學術的研究和傳承，并拜國醫大師賀普仁教授弟子程海英教授為師，學習賀氏針道。第六批全國老中醫藥專家學術經驗繼承工作繼承人；第三批《北京市中醫藥人才培養計劃》(簡稱“125計劃”)初級人才培養人員。
社會任職
中華中醫藥學會皮膚科分會青年委員
獲獎榮譽
第五屆“中醫藥社杯”全國高等中醫院校青年教師基本功競賽中醫臨床初中級組三等獎
2016年北京中醫藥大學教師講課比賽總決賽特等獎。
